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こんにちは、東京原宿クリニック 院長 篠原岳です。
「低FODMAPをかなり頑張っているのに、お腹の張りが戻ってくる」
「一度よくなったSIBOが、数か月するとまた繰り返す」
「食べ物には気をつけているのに、夕方になるとガスや膨満感が強くなる」
こうした相談は、診察室でも少なくありません。
SIBO(小腸内細菌異常増殖)が疑われる方は、まず食事内容を見直します。低FODMAP食、糖質の調整、発酵食品の中止、プロバイオティクスの見直し。どれも症状を整理するうえで大切な視点です。
ただ、ここで見落とされやすいことがあります。
それは、何を食べるかだけでなく、いつ食べるかです。
小腸には、食事と食事の間に働く「清掃波」があります。専門的には MMC(Migrating Motor Complex:消化管清掃波) と呼ばれます。これは、空腹時に胃から小腸へ向かって起こる掃除のような運動です。
食べ物の残り、剥がれ落ちた細胞、余分な細菌を大腸側へ流していく。いわば小腸の夜間清掃員のような役割を持っています。
ところが、だらだら食べる、少しずつ間食する、カロリーのある飲み物をこまめに飲む。こうした習慣があると、胃腸は「空腹時モード」ではなく「食後モード」に切り替わりやすくなります。その結果、MMCが十分に走り切る前に中断される可能性があります。
もちろん、「果物をひとかじりしただけで必ず最初からやり直し」とまで単純化する必要はありません。量、内容、液体か固形か、脂質・糖質・タンパク質の比率、人工甘味料、個人の胃排出時間によって反応は変わります。
それでも、SIBOを繰り返す方では、食べ物の種類だけでなく、食間の設計を見る価値があります。
この記事では、低FODMAPだけではうまくいかないSIBO再発を、MMC、間食、腸管運動、検査、治療の順番から4ステップで整理します。
SIBOとMMCをどう考えるか
SIBOとは、小腸の中で細菌が過剰に増え、腹部膨満、ガス、腹痛、下痢、便秘、吸収不良などに関わる状態を指します。
ポイントは、細菌そのものが悪者というより、本来そこまで増えるべきではない場所で増えているということです。
大腸には多くの細菌がいます。しかし小腸は、胃酸、胆汁、消化酵素、免疫、腸管運動によって、通常は大腸より菌数が少なく保たれています。このバランスが崩れると、小腸内で糖質が発酵しやすくなり、水素、メタン、硫化水素などのガスが増えることがあります。
かつては、小腸吸引液で 10^5 CFU/mL以上 がSIBOの基準として使われることが多くありました。一方で近年は、十二指腸吸引液で 10^3 CFU/mL以上 を臨床的に意味のある閾値とする報告もあります。
つまり、SIBOの定義や検査解釈にはまだ議論があります。だからこそ、症状だけで「SIBOです」と決めつけるのではなく、症状、リスク因子、呼気検査、必要に応じた評価を組み合わせて判断することが大切です。
SIBOは、ひとまとめにすると分かりにくくなります。水素優位型では、膨満感、腹鳴、下痢傾向と関連することがあります。メタン優位型は、厳密にはSIBOではなく IMO(Intestinal Methanogen Overgrowth:メタン産生古細菌の過増殖) と呼ぶ方が正確です。便秘、腹部膨満、ガスと関連しやすいとされています。
硫化水素優位型、または ISO疑い(Intestinal Sulfide Overproduction) は、近年注目されている領域です。硫化水素産生菌が関与する可能性があり、下痢や腐卵臭のガスと関連することがあります。ただし、診断基準や治療法は、水素・メタンほど標準化されていません。
MMCは、食後ではなく、食事と食事の間に起こる腸管運動です。おおよそ1.5〜2時間程度の周期で出現するとされ、胃から小腸へ向かって波のように進みます。イメージとしては、小腸の中をゆっくり走る清掃車です。
この「掃除の時間」が足りないと、小腸内に残った栄養や細菌が停滞し、発酵しやすくなります。するとガスが増え、膨満感や腹鳴が出やすくなります。さらに不快感が出ると、何かをつまんで落ち着かせたくなり、また食後モードに戻る。
間食する → 胃腸が食後モードへ → MMCが中断される可能性 → 小腸内発酵が残りやすい → また張る
この悪循環が、低FODMAPを頑張っているのにSIBOが戻る背景にあることがあります。

よくある誤解
低FODMAP食は、とても有用な食事法です。発酵しやすい糖質を一時的に減らすことで、ガスや膨満感が軽くなる方もいます。
ただし、低FODMAPは主にIBS症状に対して研究されてきた食事介入であり、SIBOそのものを根本的に治す標準治療というより、症状負荷を下げ、食事反応を整理するための道具と考える方が現実的です。
低FODMAPを長く厳格に続けすぎると、食べられるものが減り、食物繊維や発酵性基質の不足につながることもあります。大切なのは、制限を続けることではありません。症状が落ち着いたら、再導入し、どの食品にどの程度反応するのかを見ていくことです。
食事制限は「一生の牢屋」ではなく、体の反応を観察するための一時的な実験です。
もう一つの誤解は、「食間5時間を絶対に守らないといけない」という考え方です。
食間4〜5時間は、MMCが十分に働く時間を確保するための実践的な目安です。しかし、これを誰でも絶対に守るべき必要条件と考えると、かえって危険なことがあります。
反応性低血糖がある方、糖尿病薬を使っている方、妊娠中の方、摂食障害の既往がある方、体重が落ちすぎている方では、長い食間が合わない場合があります。
実践としては、「何がなんでも5時間」ではなく、だらだら食べを減らし、胃腸が休む時間を作る。可能なら4〜5時間を目安にする。このくらいの柔らかさが、安全で続けやすいと思います。
検査についても誤解が起こりやすいところです。
SIBOやIMOの評価では、水素・メタン呼気検査が使われることがあります。食後早いタイミングでガスが上がるか、メタンが高いかなどを見るには有用です。
ただし、呼気検査だけでは「どの菌が関わっているのか」「なぜ繰り返すのか」「SIFO(小腸内真菌増殖)やピロリ菌、ディスバイオシスが絡んでいないか」までは見えにくいことがあります。
そのため当院では、呼気検査単独よりも、GI-MAPや尿中有機酸検査(OAT)を組み合わせて、腸内環境を広く見ることを重視しています。
GI-MAPでは、便中の細菌バランス、病原菌、ピロリ菌、日和見菌、真菌、消化吸収、腸管炎症、免疫状態などを総合的に確認します。必要に応じてStoolOMXを組み合わせることで、胆汁酸や短鎖脂肪酸の情報も評価できます。
OATでは、尿中に出てくる代謝産物から、腸カンジダなど真菌由来のサイン、ビタミン代謝、ミトコンドリアや酸化ストレスの傾向を見ます。SIBOとSIFOは症状が似るため、腹部膨満感が強い方では、GI-MAPとOATを組み合わせることで治療の優先順位が立てやすくなります。
つまり当院の目的は、「SIBOかどうか」だけを判定することではありません。なぜ小腸で発酵しやすい状態になっているのか、どの順番で整えるべきかを見つけることです。
検査は単独で答えを出すものではありませんが、症状、便通、食事、薬剤、既往歴、胃酸、胆汁、腸管運動と合わせて読むことで、かなり実践的な地図になります。
最後に、「除菌すれば終わり」という誤解があります。
リファキシミンなどの抗菌薬や、オレガノ、ベルベリン、ニーム、シナモン、アリシンなどのハーブ系抗菌が、臨床的に検討されることがあります。ただし、SIBOは「菌を叩けば終わり」というほど単純ではありません。
なぜその場所で増えたのか。胃酸は足りているのか。胆汁や膵液の流れはどうか。便秘はないか。甲状腺、糖代謝、手術歴、薬剤、ストレス、睡眠不足は関係していないか。
ここを見ないまま除菌だけを繰り返すと、一時的によくなっても、同じ場所にまた戻ってきます。
SIBO再発を考えるときは、除菌よりも先に、小腸が細菌を居座らせない環境を取り戻せているかを確認する必要があります。

科学的根拠に基づく4ステップ
STEP 1:まず「本当にSIBO/IMOなのか」を整理する
最初のステップは、自己診断で決めつけないことです。
SIBOを疑う症状には、食後の腹部膨満、ガス、腹鳴、腹痛、下痢、便秘、早期満腹感、栄養吸収不良などがあります。ただし、これらはIBS、便秘、胆汁酸下痢、膵外分泌不全、セリアック病、炎症性腸疾患、甲状腺疾患、婦人科疾患、薬剤性の腸症状でも起こります。
体重減少、血便、発熱、夜間に起きる下痢、貧血、強い腹痛、家族歴などがある場合は、SIBOだけで説明せず、消化器内科での評価が優先です。
評価の軸は、呼気ガス検査、GI-MAP、OAT、便通、既往歴、食事反応です。呼気ガス検査は水素・メタンのガスパターンを見る検査として使われます。GI-MAPは菌種、ピロリ菌、日和見菌、真菌、消化吸収、炎症、免疫状態を広く見るため、当院では再発背景の整理に重視しています。OATは腸カンジダなど真菌由来代謝物、栄養素利用、酸化ストレス、ミトコンドリア傾向を評価し、SIFOや代謝背景を考える材料にします。
ここで大切なのは、検査を増やすことではありません。「どこに停滞があるのか」を見つけることです。
STEP 2:間食を責めず、食間を設計する
SIBOを繰り返す方では、低FODMAPを守っていても、1日中少しずつ食べていることがあります。
朝食、カフェラテ、ナッツ、プロテイン、果物、夕方の一口お菓子、寝る前の豆乳。一つひとつは健康的に見えても、胃腸にとっては「また食べ物が来た」という信号になります。
そこでまずは、食事の回数を責めるのではなく、記録します。起床後から寝るまで、口に入れたものを時間つきで書く。水・無糖のお茶以外の飲み物も書く。食後何時間で張るかを見る。便通、睡眠、ストレス、月経周期も一緒に見る。
そのうえで、可能な範囲で食間を整えます。実践の目安は、食間4〜5時間です。これはMMCが十分に働く時間を確保するための実践的な目安であり、医学的な絶対ルールではありません。
最初から完璧にやる必要はありません。まずは「だらだら食べ」を減らすこと。次に、朝昼夕の食事をある程度固定すること。それから、夕食後の夜間断食を12時間前後に整えること。
ただし、食間を空けることで動悸、冷や汗、強い不安、手の震えが出る方は、反応性低血糖など別の問題が隠れている可能性があります。その場合は、無理に空腹時間を延ばさず、医療者と相談しながら補食の質を整えます。
目的は我慢大会ではありません。小腸が掃除できる時間を、生活の中に取り戻すことです。
STEP 3:MMCを止める背景を探す
食間を整えても戻る場合、MMCそのものを弱めている背景を見ます。
MMCは、単に「食べなければ勝手に動く」ものではありません。胃酸、胆汁、迷走神経、腸管神経、甲状腺、血糖、睡眠、ストレス、薬剤などの影響を受けます。
見直したいポイントは、便秘、低胃酸・消化力低下、甲状腺機能低下、糖尿病・血糖変動、腸管運動に影響する薬剤、ストレス・睡眠不足です。
機能性医学では、迷走神経を整えるために、腹式呼吸、ハミング、ガーグリング、軽い運動、食後の散歩などを使うことがあります。また、医師の管理下で消化管運動改善薬やプロキネティクスが検討されることもあります。
一方で、5-HTPを「MMC再発予防サプリ」として一般化するのは慎重であるべきです。セロトニン系が腸管運動に関わることは知られていますが、5-HTPを使えばMMCやSIBO再発が改善する、という臨床的根拠は十分ではありません。睡眠、気分、薬剤相互作用にも関わるため、使う場合は個別判断が必要です。
STEP 4:除菌・ハーブ・バイオフィルムは「補助」として個別化する
SIBOが強く疑われ、症状や呼気検査、背景因子から必要と判断される場合、抗菌薬やハーブ系抗菌が検討されることがあります。
ハーブ療法としては、オレガノ、ベルベリン、ニーム、シナモン、アリシンなどが臨床的に使われることがあります。ただし、「水素型にはこれ」「メタン型にはこれ」と固定プロトコルで断定するのは避けた方が安全です。
SIBOのタイプ、便通、肝腎機能、薬剤相互作用、硫黄不耐、ヒスタミン反応、妊娠可能性、胃腸の弱さによって、合うものは大きく変わります。
再発例や難治例では、バイオフィルムが関与する可能性も考えられます。NACや酵素系サプリが補助的に使われることがありますが、SIBOにおける根拠はまだ限定的であり、標準治療というより補助的選択肢です。
そして、除菌よりも大切なのが、その後です。食間を整える。便秘を改善する。低FODMAPを必要以上に長期化させない。食べられるものを少しずつ戻す。タンパク質、鉄、亜鉛、ビタミンD、マグネシウムなどの不足を確認する。睡眠とストレス反応を整える。
SIBO再発を防ぐには、「菌を減らす」だけでなく、菌が増えにくい流れを作ることが必要です。

まとめ
低FODMAPを頑張っているのにSIBOが繰り返すとき、食べ物の種類だけを見ていると、原因を見落とすことがあります。
今日の要点です。
– SIBOは小腸内で細菌が増えすぎる状態ですが、定義や検査解釈には議論があります
– メタン優位はIMO、硫化水素優位はISO疑いとして、水素型SIBOと分けて考える方が正確です
– MMCは空腹時に働く小腸の清掃波で、食後モードでは中断されやすくなります
– 食間4〜5時間は実践的な目安であり、誰にでも絶対のルールではありません
– 当院ではGI-MAPやOATを重視し、呼気ガスだけでは見えにくい菌種、真菌、ピロリ菌、消化吸収、炎症、代謝背景まで合わせて整理します
– ハーブ、NAC、バイオフィルム対策は補助的選択肢であり、個別調整が必要です
SIBOが繰り返すのは、あなたの努力が足りないからではありません。むしろ、食事制限を頑張りすぎて、体の声が見えにくくなっていることもあります。
大切なのは、低FODMAPをさらに厳しくすることではなく、食間、腸管運動、便通、胃酸、睡眠、ストレス、検査結果を一つずつ整理することです。
食べられないものを増やすのではなく、食べられるものを取り戻す。そのために、まずは「何を食べるか」だけでなく、「いつ食べているか」を観察してみてください。
関連リンク
– SIBO詳細ガイド / 東京原宿クリニック
– GI-MAP腸内環境検査 / 東京原宿クリニック
– 栄養療法外来のお問い合わせ / 東京原宿クリニック
– 公式LINE / 東京原宿クリニック
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免責事項
この情報は医療・健康に関する情報提供を目的としたものです。特定の疾患の診断・治療を目的としたものではありません。体調に関するご判断は必ず医療機関にご相談ください。
(文責)東京原宿クリニック院長 篠原岳











